清朝末期，在吉林省城东局子设立“吉林中等农学堂”；

将农学堂改为“第一国民高等学校”，校址迁往吉林的八百垅。国民党占领吉林后，与白山的斋斋农林学校合并，改名为“吉林省立农科职业学校”；

学校迁往吉林九站农业实验场，校名改为“吉林省立农业学校”；

学校由九站迁至吉林市江南，改名为“吉林省立农业专门学校”；解放后第一批学生分设农业、畜产兽医、农田水利科，修业期限四年。在校243人，并有47人毕业。

增设了林业专修科，10月，抗美援朝战争爆发，城市疏散人口，学校暂时迁到吉林省桦甸县朝阳沟；

人民政府拨款50亿（当时货币），在吉林市郊区建立新校舍，年底校舍建成后迁回新校址；

将“吉林省立农业专门学校”更名为“吉林省农业技术学校”，学校改制为中等专业学校。8月，林学专业合并到吉林省林业学校；

将“吉林省农业技术学校”改为“吉林省农业学校”；

水利专业合并到沈阳东北水利学校，随迁教师17名，学生78名；

通化农校并入吉林省农业学校，随迁学生322人和部分教师，在校生达到2402人，教职工400人，其中教师190人；

增设“兽医专业”大专班并招收一年制“社来社去”班500人，在校学生达3079人，教职工增加到654人；

学校增设了水产、农业气象专业，由农、畜两个专业抽出5个班学生，成立了特产系，兽医专业大专班并到军委兽医大学；

水产专业并入吉林省大赉水产学校；

特产系迁到吉林特产学院；

增设会统专业。成立了函授部，面向全省招生；

增设农电专业，长春电力技工学校两个农电班并入我校，招收“社来社去”班13个；

学校与吉林省九站农业科学研究所合并，实行以所办学，改名为“吉林省九站农业劳动大学”设立农学系；6月，文革兴起，学校遭到严重摧残和破坏，停止招生，教学和科研活动被迫停止；

恢复招生，招收“社来社去”学生280人，学制一年；

撤消吉林省九站农业劳动大学，改名为“吉林省农业学校”;

日本神内良一援助项目在东京签订，确定神内吉林农业技术研修中心在吉林省农业学校建立；

由原中专学校改制为高职院校，经教育厅批准并入北华大学，组建职业技术学院，继续保留“吉林省农业学校”校名，人、财、物相对独立；

经教育厅批准，正式并入北华大学，定名为“北华大学农业技术学院”，7月13日正式举行揭牌仪式；

根据吉林省人民政府吉函（2003）85号文件精神，吉林特产高等专科学校与北华大学农业技术学院实体合并，组建新的吉林特产高等专科学校；

教育部专家组在四川对全国升本学校进行评估，学校以全票通过，升格为本科院校，校名为“吉林农业科技学院”；

中华人民共和国教育部教发函[2004]98号文件《教育部关于同意建立吉林农业科技学院的通知》发给吉林省人民政府。